人體到底需要多少益生菌一直是科學家們研究和爭論的焦點。不過，大多都讚同每日攝入益生菌的量取決於補充益生菌的目的
1、酸奶、奶酪等奶類或奶製品
酸奶：大部分酸奶或酸奶製品一般只含有保加利亞乳桿菌和嗜熱鏈球菌兩種菌，不含有活性益生菌，或是加入的益生菌被滅活。在酸奶中添加益生菌，可包括嗜酸乳桿菌、乳雙歧桿菌、乾酪乳桿菌、羅伊氏乳桿菌等菌種。雖然酸奶並不是益生菌的最好補充來源，但酸奶具有乳酸菌發酵過程中產生的一系列有益人體的代謝產物如維生素、酶，以及豐富的蛋白質和鈣，也是非常值得吃的食物。
奶酪：一些用發酵方法製成的奶酪中含有活性益生菌，奶酪中常用的益生菌有植物乳桿菌、雙歧桿菌、丙酸桿菌等。一般發酵時間越長，奶酪中有益健康的益生菌代謝產物也就越多。平時可以適當多吃一些純奶酪。
2、泡菜、味噌、豆豉等發酵食品
平時也可適當吃一些用蔬菜、水和穀物等製成的發酵食品，如泡菜、味噌、豆豉等。以發酵型的泡菜為例，它除了含有益生菌，還有一些有益的代謝產物，而且泡菜本身的膳食纖維和多種抗氧化劑有助於益生菌的生長繁殖。平時可以適當吃這類發酵食品，但不建議作為補充益生菌的主要途徑。
3、益生菌飲料
常見的益生菌飲料主要是指乳酸菌飲料，分為未殺菌乳酸菌飲料和殺菌乳酸菌飲料兩種。根據國家乳酸菌飲料衛生標準(GB16321-2003)的規定，前者出廠時每毫升含有的乳酸菌數量必須≥100萬個(10的6次方)單位(cfu)。國家衛生部在2001年《益生菌類保健食品評審規定》中規定：不提倡以液態形式生產益生菌類保健食品活菌產品。因為在運輸、銷售、儲藏過程中難以保證益生菌的存活率。建議購買時到正規超市、選擇冷藏的(一般是未殺菌乳酸菌飲料)、接近生產日期、低糖低能量的乳酸菌飲料。
4、益生菌補充劑
目前市場上益生菌產品的劑型種類繁多，有膠囊、片劑或固體飲料等，既有益生菌食品，也有以“藍帽子”註冊獲批的益生菌保健產品
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